Farò analisi dei dati di bioinformatics usando python e r

Sono un bioinformatico e sviluppatore Python/R con oltre 5 anni di esperienza nell'elaborazione di dataset NGS e nello sviluppo di workflow analitici. Co-autore di 15 pubblicazioni peer-reviewed (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).

Servizi:

• Analisi dati NGS: WGS/WES (GATK, prioritizzazione SNP, chiamata varianti), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker), e Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
• Scripting in bioinformatics: script personalizzati e sviluppo di pipeline in Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) e R (Bioconductor).
• Strumenti & ambienti: BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
• Visualizzazione dati: figure pronte per pubblicazioni usando Matplotlib, Seaborn, Plotly e ggplot2.

Output:

• Dati di sequenza elaborati e file di varianti (VCF, BAM, BED, matrici di conteggio).
• Codice pulito, documentato e ambienti riproducibili.
• Rapporti riepilogativi con figure e interpretazioni dei dati.

Contattami prima di effettuare un ordine per discutere la struttura dei tuoi dati e le esigenze del progetto.