Eseguirò analisi di metagenomica, microbioma, rna seq

Effettuerò analisi esperte di bioinformatica, RNA-Seq, scRNA-Seq, metagenomica e dati NGS.

Come bioinformatico professionista, fornisco analisi di alta qualità e riproducibili per progetti di ricerca, accademici e industriali. Che tu abbia dati di sequenziamento grezzi o bisogno di approfondimenti biologici, trasformerò i tuoi dati in risultati chiari e pronti per la pubblicazione.

I servizi includono:

• Analisi di bulk RNA-Seq e single-cell RNA-Seq (scRNA-Seq): espressione genica differenziale, clustering, arricchimento di pathway
• Analisi di metagenomica e microbioma (16S rRNA, ITS, metagenomica shotgun, profilazione tassonomica e analisi della diversità)
• Elaborazione dati NGS / WGS, chiamata di varianti e annotazione
• Analisi dell'espressione genica, trascrittomica e annotazione funzionale

Strumenti e tecnologie:

• R / Bioconductor: DESeq2, edgeR, Seurat, clusterProfiler, limma
• QIIME2, Mothur, Kraken2, MetaPhlAn
• Python: Scanpy, Pandas, Biopython
• Strumenti di allineamento e QC: FastQC, Trimmomatic, STAR, HISAT2

Deliverables:

• Rapporti completi di controllo qualità e preprocessing
• Figure e visualizzazioni di qualità da pubblicazione (heatmap, grafici a volcano, PCA, alberi filogenetici, ecc.)
• Rapporto completo in HTML/PDF con risultati statistici e interpretazione biologica