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Faro' analisi di espressione differenziale rna seq e grafici deseq2
Analista di Bioinformatica RNA Seq, Docking Molecolare e Simulazioni MD
Sono un biologo computazionale specializzato in trascrittomica RNA-Seq, docking molecolare e simulazioni di docking molecolare. Lavoro con pipeline Linux Bash, R (DESeq2/Bioconductor), Python e GROMAC...
Informazioni su questo servizio
Benvenuto nel mio servizio di Biologia Computazionale & Trascrittomica!
Se cerchi un'analisi accurata e pronta per la pubblicazione dei dati di RNA-Sequencing (RNA-Seq), offro pipeline trascrittomiche complete utilizzando strumenti di biologia computazionale di livello industriale in Linux Bash, R e Python.
Servizi che offro:
Controllo qualità & trimming (FastQC, Trimmomatic)
Allineamento Read splice-aware (HISAT2)
Quantificazione dei geni (featureCounts)
Analisi di espressione genica differenziale (DESeq2 in R)
Visualizzazioni ad alta risoluzione (Volcano Plots, Heatmaps raggruppate, PCA)
Analisi di arricchimento funzionale (GO & KEGG Pathway Analysis)
Cosa riceverai:
1. Dataset puliti e tabelle Excel annotate dei DEG con fold change e p-value corretti.
2. Grafici vettoriali/PNG ad alta risoluzione (300+ DPI) pronti per la pubblicazione.
3. Script R riproducibili e ben commentati.
4. Rapporto analitico in PDF riassuntivo.
Contattami prima di ordinare per discutere la dimensione del dataset e i requisiti del progetto!
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
•
SPSS
•
SQL
•
NoSQL
Strumenti:
Minitab
•
RStudio
•
Stata
•
Google Colab
•
Microsoft Excel
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Quali file di input devo fornire?
Puoi fornire file FASTQ grezzi o una matrice di conteggio genico insieme alla tabella di progettazione sperimentale (Campioni di controllo vs trattati).
Riceverò il codice R riproducibile?
Sì, vengono forniti script R completi e puliti con commenti nei pacchetti standard e premium per massima trasparenza e riproducibilità.
