Farò simulazioni di dinamica molecolare MD usando gromacs o desmond

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Sono un ricercatore nel campo della scoperta di farmaci computazionale con una forte esperienza in docking molecolare, simulazioni di dinamica molecolare (MD), teoria del funzionale della densità (DFT...
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Informazioni su questo servizio

Offro servizi professionali di simulazione di dinamica molecolare (MD) utilizzando GROMACS e Desmond per ricerche accademiche, industriali e farmaceutiche.

Le simulazioni di dinamica molecolare aiutano a comprendere la stabilità delle proteine, la flessibilità, i cambi conformazionali e le interazioni tra proteina e ligando a livello atomico. Se lavori su scoperta di farmaci, studi sugli enzimi o sistemi biomolecolari, questa gig ti fornirà risultati precisi, ripetibili e pronti per la pubblicazione.

Ho esperienza pratica in complessi proteina-ligando, proteine apo/holo e piccole molecole, garantendo una corretta preparazione del sistema, la scelta del force-field e analisi dettagliate.


SOFTWARE & STRUMENTI

GROMACS

Desmond (Schrödinger)



ANALISI INCLUSA

RMSD

RMSF

Raggio di Gyration (Rg)

Analisi dei legami idrogeno

SASA

PCA

MMGBSA

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do molecular dynamics MD simulation using gromacs or desmond
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Tecnologia:

Altro

Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

•

Analisi qualitativa

Expertise:

Web Analytics

•

Statistiche

Linguaggio di programmazione:

Python

•

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    It was a pleasure working with Amna. She performed the simulation exactly as required and delivered the work ahead of time with excellent accuracy. I worked with her on MD simulations, and she executed them exceptionally well. She also provided the results in a highly professional manner and in high definition, making them easy to use and present.

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