Sfoglia categorie
Esplora
Fiverr Pro
Italiano
$
USD
Eseguirò qc, trimming e allineamento dei dati ngs usando galaxy
Studente di MPhil, esperto in bioinformatica e scoperta di farmaci
Studente di MPhil specializzato in Bioinformatica e Nanobiotecnologia.
Colmo il divario tra scoperta di farmaci computazionale e sintesi in laboratorio. Con competenze in Molecular Docking (AutoDock ...
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno di aiuto per processare i tuoi dati di sequenziamento NGS grezzi? Offro controlli di qualità affidabili, trimming e allineamento usando la piattaforma Galaxy, così ottieni dati puliti e pronti per l'analisi senza dover imparare tu stesso la pipeline.
Quello che posso fare:
Recuperare i dati di sequenziamento da NCBI/SRA (fasterq-dump)
Eseguire FastQC per la valutazione della qualità
Trim e pulizia delle reads (Trimmomatic)
Allineare le reads a un genoma di riferimento (Bowtie2, HISAT2)
Fornire un riepilogo chiaro dei risultati
Lavoro anche con altri strumenti Galaxy oltre a questi, se il tuo progetto necessita di qualcosa di specifico, scrivimi prima e ti confermerò se posso aiutarti.
Sono all'inizio del mio percorso come freelance con esperienza pratica in NGS QC, trimming e allineamento, ottima opzione per progetti semplici a un prezzo accessibile.
Nota: Ideale per dataset di piccole e medie dimensioni (ad esempio, sequenziamenti mirati, esperimenti di small RNA-seq). Per dataset molto grandi, scrivimi prima per confermare la fattibilità.
Inviami i dettagli del tuo dataset (organismo, tipo di sequenziamento, dimensione del file) prima di ordinare, e ti confermerò i tempi di consegna.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
In quale formato devo inviare i miei dati?
File FASTQ, o un numero di accesso SRA se i tuoi dati sono pubblicamente disponibili su NCBI.
Quanto grande può essere un dataset che puoi gestire?
Lavoro meglio con dataset di piccole e medie dimensioni (ad esempio, sequenziamenti mirati, small RNA-seq). Per dataset più grandi, scrivimi prima così posso confermare la fattibilità considerando i limiti di spazio di archiviazione del server Galaxy.
Fornisci file di output grezzi o un rapporto riassuntivo?
Riceverai entrambi — i file di output processati più un riassunto chiaro che spiega le metriche di qualità e eventuali problemi riscontrati.
Cosa succede se i miei dati necessitano di uno strumento non elencato nel tuo gig?
Scrivimi con i dettagli prima di ordinare — lavoro con diversi altri strumenti Galaxy e posso confermare se posso aiutarti.
Puoi aiutare a interpretare i risultati, non solo a generarli?
Sì, posso includere una breve spiegazione di cosa significano i risultati di QC/allineamento per il tuo dataset specifico.
