Analizzerò i dati ngs fastq usando fastqc e fornirò un rapporto di controllo qualità

Benvenuto nel mio servizio

Analizzerò professionalmente i tuoi dati di sequenziamento NGS (file FASTQ) e fornirò un rapporto di controllo qualità chiaro e facile da capire usando FastQC.

Questo servizio ti aiuta a capire se i tuoi dati di sequenziamento sono abbastanza buoni per analisi successive come RNA-seq, chiamata di varianti o studi sul genoma.

Cosa farò?

• Qualità complessiva della sequenza
• Distribuzione del punteggio di qualità per sequenza
• Analisi del contenuto di GC
• Livelli di duplicazione delle sequenze
• Controllo contaminazione da adattatori
• Distribuzione della lunghezza delle read
• Identificazione di avvisi e moduli falliti

Tutti i risultati saranno spiegati chiaramente, anche se non sei bioinformatico.

Strumenti che uso

• FastQC
• Linux (ambiente Ubuntu)
• Workflow professionale basato su riga di comando

Cosa riceverai

Otterrai:

• Rapporto HTML di FastQC
• Grafici di qualità (come il grafico del punteggio di qualità per sequenza)
• Spiegazione semplice di PASS / WARN / FAIL
• Raccomandazioni chiare (i tuoi dati sono utilizzabili o meno?)

Se necessario, ti guiderò anche sui prossimi passi (ritaglio, filtraggio o analisi).

Tipi di dati supportati

• RNA-seq
• DNA-seq
• WGS / WES
• File FASTQ Illumina
• Dati single-end o paired-end

Perché scegliermi

• Background in bioinformatics
• Esperienza di ricerca reale
• Rapporti puliti e onesti
• Consegna rapida