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Farò analisi bioinformatica rna seq, docking proteico, blast, msa
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Bioinformatico
Sono un analista di bioinformatica specializzato in analisi di sequenze, strutture e funzioni delle proteine. Utilizzo strumenti come BLAST, MSA, AlphaFold, InterPro e STRING per fornire report precis...
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno di analisi bioinformatica precisa e riproducibile su cui puoi fare affidamento?
Offro analisi bioinformatica chiare, pronte per la pubblicazione, che coprono RNA-seq, sequenza/struttura delle proteine e docking molecolare, con tutta la documentazione necessaria per farti capire esattamente come sono stati generati i risultati.
Ciò che offro:
Analisi RNA-seq e espressione genica differenziale (DGE, volcano plot, heatmap)
Analisi della sequenza proteica (BLAST, ricerca di omologhi)
Allineamento di sequenze multiple (MSA) e identificazione di regioni conservate
Costruzione di alberi filogenetici e analisi evolutiva
Previsione della struttura delle proteine (AlphaFold, pLDDT per la fiducia)
Annotazione di domini e motivi (InterPro, Pfam, SMART)
Reti di interazioni proteina-proteina (STRING)
Docking molecolare e analisi dei siti di binding (AutoDock Vina)
Report pronto per il cliente con figure, codice e interpretazione
Con chi lavoro: ricercatori, studenti e startup biotech che hanno bisogno di analisi pulite e documentate per articoli, tesi o report, non solo output grezzo.
Deliverables: codice riproducibile (Python/R), figure di qualità pubblicabile, interpretazione scritta dei risultati.
Nota: scrivimi prima con il tuo dataset/proteina/domanda così posso confermare l'ambito prima di procedere con l'ordine.
Tecnologia:
Quaderno jupyter
•
Pandas
•
RStudio
•
Altro
Expertise:
Predizione
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Di quali dati/file hai bisogno da me per iniziare?
Per RNA-seq: file FASTQ grezzi o un numero di accesso GEO/SRA. Per analisi proteiche: una sequenza proteica (FASTA) o ID UniProt/PDB. Per docking: la struttura del tuo ligando (SMILES o SDF) e la proteina target. Se non sei sicuro di cosa hai, scrivimi e ti guiderò.
Forni il codice insieme ai risultati?
A: Sì — ogni pacchetto include codice Python/R pulito e commentato, insieme alle figure e al report, così puoi riprodurre o modificare l'analisi da solo.
Posso usare questi risultati nella mia tesi o in un articolo pubblicato?
Sì, tutta l'analisi viene fatta usando strumenti e metodi standard, revisionati da pari, e i risultati sono tuoi per usarli liberamente in lavori accademici.
Non sono sicuro di quale package mi serve — possiamo parlarne prima?
Certo — scrivimi con il tuo dataset o la domanda di ricerca prima di ordinare e ti consiglierò il package giusto e ti confermerò i tempi di consegna.
Offrite delle revisioni se ho bisogno di apportare modifiche all'analisi?
Il pacchetto Premium include 1 revisione. Per Basic/Standard sono incluse piccole chiarificazioni — per modifiche più approfondite all'ambito dell'analisi, possiamo discutere un preventivo personalizzato.
