Scriverò di bioinformatica, genomica, proteomica ed evoluzione

Hai problemi a usare i dati di sequenziamento grezzi per ottenere un significato biologico?

Ho una buona esperienza come Bioinformatico e sono in grado di offrire tutte le analisi di dati bioinformatici necessarie per le tue ricerche in modo completo e pronto per la pubblicazione. Che tu sia uno scienziato accademico, una startup biotech o un professionista medico, lavorerò con i tuoi dati con la massima precisione, utilizzando pipeline di livello industriale e strumenti all'avanguardia.

Cosa offro:

Analisi di sequenziamento di nuova generazione (NGS): RNA-Seq di massa, RNA-Seq singola cellula (scRNA-Seq), analisi di differenziale di espressione genica (DGE).

Genomica - DNA-Seq, chiamata di varianti (SNPs/Indels) e assemblaggio del genoma.

Epigenomica - analisi ChIP-Seq e ATAC-Seq.

Microbioma & Metagenomica: profilazione tassonomica, annotazioni funzionali, sequenziamento 16S rRNA.

Visualizzazione avanzata dei dati: grafici di alta risoluzione, qualità pubblicabile (Volcano plot, Heatmap, PCA, rete di arricchimento di pathway/GO, grafici TSNE/UMAP).

Analisi specializzate con R (Bioconductor), Python: scripting personalizzato e pipeline.

Gli strumenti che uso:

Allineamento e QC dei dati: FastQC, Trimmomatic, STAR, HISAT2, BWA, SAMtools.

Quantificazione e DGE: DESeq2, EdgeR, K