Farò analisi di interazioni con molecular docking, gnina, autodock vina e pymol

Hai bisogno di un molecular docking preciso, pronto per la pubblicazione, per la tua ricerca o progetto di progettazione di farmaci? Offro servizi di chimica computazionale usando AutoDock Vina e GNINA (scoring CNN deep-learning), abbinati a un profilo dettagliato delle interazioni.

Cosa offro:

• Preparazione target e ligando: Riparazione della struttura, assegnazione delle cariche, protonazione a pH fisiologico e minimizzazione dell'energia.
• Molecular Docking: Ottimizzazione della griglia (docking in sito attivo o a scatola cieca) usando AutoDock Vina e GNINA per predizioni di affinità robuste (kcal/mol).
• Profilazione delle interazioni: Mappe 2D ad alta risoluzione tramite BIOVIA Discovery Studio (ponti H, pi-stacking, ponti salini) e visualizzazioni 3D ray-traced in PyMOL.

Consegne:

• File del complesso dockato (.pdb, .pdbqt, .sdf)
• Sessione PyMOL completamente modificabile (.pse)
• Figure di alta qualità pronte per la pubblicazione con DPI superiore a 300
• Tabella riassuntiva delle energie di binding e dei contatti con residui chiave

Perché scegliermi?

• Workflow metodologicamente rigoroso, conforme agli standard di peer-review
• Profonda esperienza in computer-aided drug design (CADD)
• Risposta rapida e supporto scientifico chiaro

Contattami con il PDB ID del target e le strutture dei ligandi prima di ordinare!