Farò analisi di espressione differenziale RNA-seq in r con deseq2

Sono un biologo computazionale con un MSc in Biochimica Medica e esperienza di ricerca presso A*STAR Singapore. Faccio analisi RNA-seq per ricercatori che hanno i dati e hanno bisogno di qualcuno che li interpreti.

COSA OTTIENI

- Espressione differenziale con DESeq2, correttamente impostata per il tuo design

- Figure pronte per pubblicazione a 300 dpi, in PNG e PDF

- Una tabella dei risultati che puoi inserire direttamente in un file supplementare

- Lo script di analisi, annotato, così tu o il tuo laboratorio potete rifarlo

- Un'interpretazione scritta, che include ciò che i dati NON supportano

PERCHÉ QUESTO PUNTO È IMPORTANTE

I revisori chiedono perché hai filtrato a una certa soglia, se hai corretto per batch e perché un campione è stato escluso. Tutto ciò che consegno è documentato, così puoi rispondere a queste domande.

GUARDA IL MIO STANDARD PRIMA DI ACQUISTARE

Un'analisi completa, con codice, figure e avvertimenti, è pubblica:

github.com/kND-17/hgsoc-origin-rnaseq

COSA HO BISOGNO DA TE

La tua matrice di counts (o file FASTQ), un foglio di metadati del campione e una frase su cosa vuoi scoprire. Contattami prima di ordinare se non sei sicuro di quale pacchetto sia adatto, e ti dirò onestamente.