Analizzerò i tuoi dati di metilazione del dna e epigenetica

Analizzo dati di epigenetica: metilazione del DNA (array o sequenziamento bisulfite/enzyme), ChIP-seq e ATAC-seq e li trasformo in risultati che puoi interpretare e inserire in un articolo.

Per dati di metilazione, lavoro sia con dati basati su array (Illumina 450k/EPIC) sia con dati di sequenziamento (WGBS, RRBS, EM-seq), poiché l'approccio di analisi differisce in modo significativo tra i due e ti dirò quale è rilevante per il tuo tipo di dato. Questo di solito comprende il controllo di qualità, la normalizzazione, l'analisi di metilazione differenziale tra gruppi e l'annotazione delle regioni significative a geni o caratteristiche genomiche.

Per ChIP-seq e ATAC-seq, il workflow copre l'allineamento delle letture, il chiamamento dei picchi e l'analisi di accessibilità o legame differenziale, con visualizzazione delle tracce di segnale e annotazione dei picchi.

In tutti i casi, l'output è pensato per essere interpretabile: grafici chiari, un riepilogo di ciò a cui corrispondono biologicamente le regioni o i picchi significativi, e abbastanza documentazione del metodo da poter essere inserita direttamente in una sezione sui metodi.

Scrivimi con il tipo di dato e il disegno dello studio prima di ordinare, così posso confermare l'ambito e fornirti un preventivo preciso.