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Analizzerò i tuoi dati di rna seq a singola cellula e ti fornirò approfondimenti su misura
Bioinformatico e ricercatore predoctoral con oltre 4 anni di esperienza nell'analisi di dati omici, tra cui genomica, trascrittomica, epigenomica e proteomica. Fornisco risultati di alta qualità, ripr...
Informazioni su questo servizio
Offro analisi personalizzate di rna-seq a singola cellula adattate al tuo dataset e agli obiettivi di ricerca. Ogni progetto viene personalizzato in base alla domanda biologica, applicando workflow riproducibili in R o Python (Seurat, Scanpy, ecc.) per fornire risultati di alta qualità e interpretabili.
I servizi includono:
- Controllo qualità e filtraggio
- Normalizzazione, scaling e riduzione della dimensionalità (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clustering e identificazione di geni marcatori
- Annotazione opzionale del tipo cellulare e arricchimento di pathway
- Generazione di visualizzazioni pronte per pubblicazione e report riepilogativi
Con oltre quattro anni di esperienza in bioinformatica e in molte discipline omiche, garantisco che ogni analisi sia robusta, trasparente e biologicamente significativa. Per favore contattami prima di ordinare per discutere i tuoi dati e gli obiettivi dell'analisi.
FAQ
Traduzione automatica.
Che tipo di dati posso fornire?
Puoi fornire file FASTQ grezzi (per l'elaborazione con Cell Ranger o equivalente) o matrici di conteggio processate (ad esempio .mtx, .h5 o .csv). Adatterò il workflow in base al tipo di dati e agli obiettivi del progetto.
Esegui l'elaborazione dei dati grezzi (FASTQ a matrice di conteggio)?
Sì. Questo passaggio può essere aggiunto come servizio extra e include l'allineamento delle reads, il conteggio degli UMI e la generazione della matrice di espressione adatta all'analisi downstream.
Quali strumenti utilizzi per l'analisi?
Utilizzo principalmente Seurat, Scanpy, Monocle3 e Cell Ranger, insieme ai pacchetti standard di R e Python per visualizzazione e analisi di arricchimento.
Puoi integrare più campioni o batch?
Sì. La correzione dei batch e l'integrazione di più campioni possono essere incluse come opzione aggiuntiva. Uso Seurat v4, Harmony o Scanorama a seconda delle caratteristiche del dataset.
Come discutiamo la domanda biologica o il piano di analisi?
Prima di iniziare, scambieremo alcuni messaggi per definire i tuoi obiettivi principali e i dettagli dei dati. Poi confermerò il pacchetto migliore o suggerirò un'offerta personalizzata se necessario.
Puoi aiutare a interpretare i risultati dal punto di vista biologico?
Sì. L'interpretazione è inclusa nei pacchetti Standard e Premium. Evidenzierò i cluster più rilevanti, i geni marcatori e i pathway secondo il contesto sperimentale.
Le analisi sono confidenziali?
Assolutamente sì. Tutti i dati e i risultati sono trattati come strettamente confidenziali e usati esclusivamente per il tuo progetto. Posso firmare un NDA su richiesta.
Recensioni
2 recensioni per questo servizio
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Valutazione dettagliata
- Livello di comunicazione del venditore
- Qualità della consegna
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Più rilevante
M 
mrdanielvm
Cliente abituale
Spagna
Second project with Daniel, and again an excellent experience. I highly recommend his bioinformatics expertise. .
50 USD-100 USD
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5 giorni
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Utile?M mrdanielvm
Cliente abituale
Spagna
Amazing work on RNA technologies. The results were clear, well organized and delivered on time. The results exceeded my expectations. I would definitely recommend his services.
50 USD-100 USD
$
4 giorni
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