Eseguirò analisi differenziale dell'espressione genica con rna seq

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Bioinformatica, Biologia Molecolare, Analista di Dati

La biologia crea i dati. Io aiuto a renderli chiari. Lavoro con dataset biologici e di ricerca, trasformando risultati grezzi in file puliti, grafici significativi e spiegazioni semplici. La mia espe...
Informazioni su questo servizio
<pHai difficoltà con i tuoi dati RNA-Seq e non sai da dove iniziare? Eseguirò un analisi completa di espressione genica differenziale (DGE) dai conteggi grezzi fino a intuizioni biologiche.

Cosa farò:

  • Controllo qualità (FastQC, MultiQC)
  • Allineamento delle reads (HISAT2/STAR)
  • Quantificazione dei geni (featureCounts/HTSeq)
  • Espressione differenziale usando DESeq2 / edgeR
  • Grafici volcano, heatmap, PCA
  • Analisi di arricchimento di pathway GO & KEGG
  • Rapporto finale con interpretazione


Linguaggio di programmazione:

Python

R

Tecnologia:

Altro

Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

analisi statistica

Expertise:

Statistiche

Strumenti:

Altro

Il mio portfolio