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Eseguirò docking molecolare e screening virtuale per la progettazione di farmaci
Analista di bioinformatica e visualizzazione dei dati RNA Seq
Aiuto i ricercatori a trasformare i dati biologici in risultati chiari e riproducibili. Il mio focus è sull'analisi bulk RNA-seq usando R e DESeq2, inclusi espressione differenziale, PCA, volcano plot...
Informazioni su questo servizio
Esplora le interazioni tra proteina e ligando con un flusso di lavoro di docking molecolare e screening virtuale chiaramente definito.
Preparerò la struttura proteica fornita e il set di ligandi, eseguirò il docking contro un sito di binding concordato e organizzerò i risultati in file utilizzabili e figure chiare.
A seconda del pacchetto, i deliverable includono:
- Punteggi di docking e pose di binding classificati
- Figure di interazione 2D/3D
- Analisi comparativa dei ligandi selezionati
- Previsioni ADME per i primi 5 composti in Premium
- Metodi, impostazioni chiave e un riassunto scritto dei risultati
Tutti i pacchetti coprono un bersaglio proteico. Basic include fino a 5 ligandi, Standard 20 e Premium 50. Per favore, invia la struttura PDB o l'ID, le strutture/ID dei ligandi, i dettagli del sito di binding e il tuo obiettivo di ricerca prima di ordinare.
I punteggi di docking e i risultati ADME sono previsioni computazionali, non prove di attività biologica. Dinamiche molecolari, QSAR, modellazione proteica e altri bersagli richiedono una valutazione separata. Le revisioni coprono l'ambito concordato; nuovi composti o bersagli sono extra.
Contattami prima così possiamo confermare la qualità dell'input, l'ambito e la consegna.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Cosa devo inviare prima di ordinare?
Invia il file PDB o l'ID della proteina, i file SDF/MOL2 o gli ID dei ligandi, il sito di binding target, il ligando di riferimento se disponibile e l'obiettivo dello studio. Confermerò la fattibilità e l'ambito prima che tu ordini.
Sono inclusi dinamiche molecolari e validazione sperimentale?
No. Questi pacchetti coprono il docking computazionale e le analisi indicate. I punteggi non dimostrano binding, efficacia o sicurezza. Le simulazioni MD, QSAR e altri bersagli sono fuori dai pacchetti elencati.
