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Eseguirò analisi dei dati scrnaseq
Ricercatore post-dottorato in Bioinformatica
Sono un ricercatore post-dottorato in Bioinformatica presso biobank.cy, Università di Cipro, con competenze nell'analisi di dati omici, sviluppo di applicazioni web innovative e machine learning. Prog...
Informazioni su questo servizio
Eseguirò un'analisi di alta qualità dei dati single-cell RNA-seq (scRNA-seq) utilizzando pacchetti R come Seurat, SingleR, SingleCellSignalR e AUCell per aiutarti a scoprire insight significativi dal tuo dataset.
Che tu sia uno studente, ricercatore o faccia parte di un laboratorio biotech, offro un workflow di analisi affidabile, riproducibile e pronto per la pubblicazione, insieme a interpretazione dei risultati.
La mia analisi include:
- Controllo di qualità (QC) e filtraggio di cellule e geni
- Normalizzazione, scaling e integrazione dei dati (se necessario)
- Riduzione della dimensionalità (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clusterizzazione delle cellule e identificazione di geni marcatori
- Analisi di espressione differenziale tra cluster o condizioni
- Arricchimento funzionale (GO/KEGG) dei geni marcatori
- Grafici pronti per la pubblicazione (UMAP/t-SNE, heatmap, feature plot)
- Rapporto riassuntivo chiaro e script Seurat riproducibili.
Posso lavorare con matrici di conteggio grezze o dati processati.
Se hai requisiti specifici, condizioni sperimentali o genome di riferimento preferito, contattami prima di ordinare.
Le consegne sono personalizzate in base alla dimensione del dataset e agli obiettivi di ricerca, assicurando che i tuoi risultati di scRNA-seq siano pronti per presentazioni, tesi o pubblicazioni.
