Analizzerò dati di rna seq bulk e singola cella


Informazioni su questo servizio
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Stai cercando un esperto di bioinformatica che comprenda davvero il significato medico e biologico dietro il codice?
Sono un Medico Chirurgo e Ricercatore in Oncologia specializzato in transcriptomics. Colmo il divario tra dati grezzi e intuizioni biologiche pronte per la pubblicazione, assicurando che i tuoi risultati siano non solo statisticamente significativi, ma anche biologicamente rilevanti.
I miei servizi includono:
- Analisi di RNA-seq bulk: controllo qualità, analisi di espressione differenziale (DESeq2/edgeR), arricchimento di pathway (GO/KEGG/GSEA) e analisi di sopravvivenza.
- Single-Cell RNA-seq (scRNA-seq): clustering delle cellule e riduzione della dimensionalità (UMAP/t-SNE), annotazione dei tipi cellulari, inferenza delle traiettorie e comunicazione cellula-cellula.
- Visualizzazione dati e grafica: figure di alta qualità pronte per la pubblicazione (Heatmaps, Volcano plots, Violin plots, layout multi-panel) e design personalizzati di poster scientifici.
Perché scegliermi?
- Doppio background: Interpreto i dati attraverso una prospettiva clinica, risparmiandoti tempo nella spiegazione della biologia di base.
- Competente in R & Python: Script personalizzati e riproducibili usando Jupyter o RStudio.
Contattami PRIMA di ordinare per discutere i dettagli del tuo progetto e il formato dei dati!
Scopri di più su Dongyao Zhang
As a clinical MD and active oncology researcher, my dual background bridges th
- DaCina
- Membro daapr 2026
- Tempo di risposta medio1 ora
Lingue
Cinese, Inglese
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FAQ
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Che tipo di formato dati hai bisogno per iniziare l'analisi?
Di solito inizio con matrici di conteggio (.csv/.txt), file h5 o oggetti Seurat/Scanpy. Se hai solo file FASTQ grezzi, contattami prima, perché l'allineamento sequenziale grezzo richiede un'offerta personalizzata.
Fornisci anche il codice sorgente (script R o Python) insieme ai risultati?
Assolutamente! Prioritizzo la riproducibilità nella ricerca. Consegnò script R puliti e commentati o Jupyter Notebook Python insieme alle figure ad alta risoluzione e alle tabelle di dati finali.
Puoi aiutare a interpretare il significato biologico dietro i risultati dell'analisi?
Sì! Come medico e ricercatore in oncologia, non mi limito a eseguire modelli statistici. Posso aiutarti a interpretare arricchimenti di pathway, interazioni cellula-cellula e la loro rilevanza clinica per il tuo studio.
Le visualizzazioni dei dati sono pronte per la pubblicazione su riviste?
Sì. Fornisco figure ad alta risoluzione (PDF/TIFF) come UMAP e heatmap. Con la mia esperienza in poster scientifici e design grafico, posso anche personalizzare colori e layout multi-panel per la rivista di destinazione.

