Analizzerò i tuoi dati bulk rnaseq con figure pronte per la pubblicazione

Hai difficoltà con l'analisi RNA-seq? Trasformerò i tuoi dati di sequenziamento grezzi in risultati di qualità pubblicabile.

COSA OTTIENI:

Rapporti di controllo qualità (FastQC, MultiQC)

Analisi di espressione differenziale (DESeq2 o edgeR)

Grafico volcano che mostra geni up/downregolati

Grafico PCA con raggruppamento dei campioni

Heatmap dei geni più differenzialmente espressi

Analisi di arricchimento di pathway GO/KEGG

File CSV con tutte le statistiche e le liste di geni

Sezione metodi scritta (pronta per il tuo articolo)

COSA HO BISOGNO DA TE:

- File FASTQ (o numeri di accesso SRA)

- Informazioni sui campioni (quali sono controllo vs trattamento)

- Nome dell'organismo (posso lavorare con qualsiasi specie con un trascrittoma)

Utilizzo strumenti standard del settore: Salmon/STAR per l'allineamento, DESeq2/edgeR per le statistiche, clusterProfiler per l'analisi dei pathway. Tutto l'analisi è completamente riproducibile con codice documentato.

ESPERIENZA: RNA-seq multi-tessuto (cervello, fegato, rene, testicoli, grasso), esperimenti a serie temporali (risposta alla fotoperiodo), dati a basso conteggio e trascritti rari, chiamata di varianti cliniche da RNA-seq, organismi non modello senza annotazione.

Domande? Scrivimi prima di ordinare. Sono felice di discutere le tue esigenze specifiche e raccomandare il pacchetto giusto!