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Analizzerò dati di microbioma e metagenomica 16s shotgun in r e python
Bioinformatico
Ciao a tutti, sono Hazrat Maghaz, studente dell'Interdisciplinary School of Science and Engineering (SINES) NUST Pakistan.
Ho competenze in Bioinformatica | Genomica | Sequenziamento di nuova generazi...
Livello 1
Ha soddisfatto determinati criteri di prestazione e mostra un forte potenziale nel marketplace.
Informazioni su questo servizio
Sblocca il potere delle intuizioni microbiche con un'analisi esperta di metagenomica
Benvenuto! Sono un ricercatore bioinformatico formato con esperienza pratica in metagenomica avanzata, profilazione del microbioma e analisi dei dati genomici. Mi specializzo nell'estrazione di approfondimenti approfonditi da dati di sequenziamento complessi, siano essi da progetti di 16S, ITS, 18S rRNA o metagenomica shotgun.
Le mie soluzioni di bioinformatica sono ideali per:
- Ricercatori accademici
- Aziende biotech
- Studi sul microbioma ambientale
- Progetti sul microbioma intestinale umano/animale
Servizi che offro:
- Preprocessing dei dati grezzi: trimming, filtraggio, decontaminazione (FastQC, Trimmomatic, BBMap)
- Assemblaggio e annotazione del metagenoma (MEGAHIT, SPAdes, Prokka, EggNOG)
- Profilazione tassonomica (Kraken2, Bracken, QIIME2)
- Analisi funzionale (HUMAnN3, LEfSe, PICRUSt2)
- Metriche di diversità (Alpha, Beta; PCoA, NMDS)
- Scoperta di biomarcatori e analisi di abbondanza differenziale
- Visualizzazioni personalizzate (R, Python, ggplot2, Krona, heatmaps)
- Report scientifici dettagliati con interpretazione
Tecnologie e strumenti: QIIME2, HUMAnN, Kraken2, Bowtie2, MEGAHIT, LEfSe, R, Python, Linux, Galaxy, BBMap, EggNOG, Prokka
Decifriamo i tuoi dati e trasformiamo le sequenze in scienza.
FAQ
Traduzione automatica.
I miei dati sono confidenziali?
Al 100%. Tutti i dati condivisi saranno gestiti in modo sicuro e usati esclusivamente per il tuo progetto.
Puoi processare grandi o più dataset?
Assolutamente sì. Lavoro con dati ad alta capacità di throughput e offro prezzi personalizzati per progetti di grandi dimensioni o complessi.
Che tipo di dati accetti?
Accetto file FASTQ/FASTA da piattaforme di sequenziamento 16S rRNA, ITS, 18S e metagenomica shotgun (Illumina, Nanopore, ecc.).
Otterrò un report pronto per la pubblicazione?
Sì, posso fornire figure, tabelle e interpretazioni complete, pronte per riviste scientifiche, in base alle tue esigenze.
Puoi processare grandi o più dataset?
Assolutamente sì. Lavoro con dati ad alta capacità di throughput e offro prezzi personalizzati per progetti di grandi dimensioni o complessi.
Recensioni
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