Fornirò formazione live su zoom sulla simulazione di dinamica molecolare

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Parlo Inglese

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Ho oltre 15 anni di esperienza nelle scienze della vita negli Stati Uniti, Giappone e Bangladesh. Ho pubblicato più di 30 articoli di ricerca su riviste internazionali peer-reviewed di rilievo, tra cu...

Livello 2

Ha soddisfatto criteri di prestazioni elevate e ha una comprovata esperienza nel soddisfare le aspettative dei clienti.

Informazioni su questo servizio

Stai cercando di imparare la simulazione di dinamica molecolare (MD) attraverso sessioni di formazione chiare, pratiche e in diretta su Zoom?

Offro guida passo passo su misura per principianti, studenti e ricercatori che vogliono padroneggiare i flussi di lavoro MD usando GROMACS.


Pacchetti

Base: simulazione di proteine MD

Impara il flusso di lavoro completo per simulare una proteina in acqua.

Flusso di lavoro completo di GROMACS

Configurazione del sistema: proteina in acqua, dimensioni della scatola fino a 10 × 10 × 10 nm

Strumenti di analisi essenziali:

RMSD, RMSF, raggio di gyration (Rg), legami idrogeno


Standard: simulazione di proteina-ligando MD

Include tutto nel pacchetto Base, più:

Preparazione e simulazione di un complesso proteina-ligando in acqua

Workflow di generazione della topologia del ligando

Analisi aggiuntive rilevanti per studi di binding


Premium: simulazione MD avanzata

Include tutto nello Standard, più:

Simulazione di proteine di membrana (costruzione della membrana + inserimento)

Opzioni di analisi extra, come:

Distanza, SASA, clustering, MSD, contatti, grafici personalizzati, ecc.

Adatto a progetti complessi, a livello di pubblicazione


Informazioni importanti

Per favore condividi il file PDB della tua proteina o l'ID PDB prima della sessione.


Prezzi personalizzati si applicano per proteine molto grandi o multimeriche o analisi complesse.

Scopo della lezione:

Data science

Età dello studente:

Adulti (18-65 anni)

Tecnologia di sviluppo:

Linux

Bash

Altro