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Eseguirò analisi bioinformatica dei dati di sequenziamento
Analista bioinformatica e coordinatore di ricerca clinica
Sono laureato in Bioinformatica con un MSc, professionista della cura della salute e coordinatore di ricerca clinica specializzato in malattie infettive e ricerca sul microbioma. Supporto team accadem...
Informazioni su questo servizio
Offro supporto pratico e riproducibile in bioinformatica per progetti di sequenziamento e ricerca sul microbioma.
Posso aiutarti con organizzazione dei metadata, controlli su campioni e ID di esecuzione, controllo qualità FASTQ, trimming di adattatori e qualità, report MultiQC, rimozione di host-read, profiling tassonomico, analisi esplorativa e rapporti chiari pronti per la ricerca.
Riceverai output strutturati su misura per il tuo progetto, come file di metadata puliti, rapporti QC, tabelle riepilogative, figure e notebook o script riproducibili se inclusi nel pacchetto.
Lavoro con file Excel/CSV/TSV e dati di sequenziamento, usando Python, R, Linux, FastQC, MultiQC, fastp, KneadData, Bowtie2 e MetaPhlAn.
Fornisci solo dati de-identificati. Questo servizio è pensato per scopi di ricerca e educativi e non fornisce diagnosi cliniche o interpretazioni mediche.
Per dataset grandi, workflow personalizzati o domande di ricerca specifiche, contattami prima di ordinare così possiamo confermare l'ambito e i risultati attesi.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Con quali dati puoi lavorare?
Posso lavorare con file de-identificati Excel, CSV, TSV, FASTQ e metadata di sequenziamento. Contattami prima per BAM, VCF o altri formati.
Cosa riceverò?
A seconda del pacchetto, potresti ricevere metadata puliti, rapporti QC FASTQ, riepiloghi MultiQC, reads trimmati, tabelle tassonomiche, figure, rapporti e codice riproducibile.
Elabori file FASTQ paired-end?
Sì. Posso eseguire controllo qualità e trimming conservativo per dati di sequenziamento paired-end o single-end. Condividi il numero di file e la dimensione totale compressa prima di ordinare.
Puoi analizzare dati sul microbioma?
Sì. Supporto workflow di ricerca sul microbioma e metagenomica, inclusa organizzazione dei metadata, QC, preprocessing, profiling tassonomico e analisi esplorativa.
Fornisci interpretazione clinica o diagnosi?
No. Questo Gig è solo per scopi di ricerca e educativi. Non fornisco diagnosi cliniche, raccomandazioni terapeutiche o interpretazioni mediche.
Come devo condividere i miei dati?
Fornisci solo file de-identificati. Per dataset di sequenziamento grandi, contattami prima di ordinare per concordare un metodo di trasferimento sicuro e l'ambito del progetto.
Puoi lavorare con progetti grandi o personalizzati?
Sì. Dataset grandi, studi complessi e workflow personalizzati richiedono un'offerta su misura. Scrivimi con la tua domanda di ricerca, tipi di file, numero di campioni e dimensione totale dei file.
