Farò metagenomica, rna seq, analisi dei dati genomici e bioinformatica per te

Hai dati di sequenziamento sul tuo hard disk in attesa di essere analizzati? Conosco la sensazione: hai eseguito l’esperimento, ottenuto i file FASTQ e ora hai bisogno di qualcuno che sappia davvero come trasformare quelle letture in risultati che il tuo PI o i revisori approveranno.

È esattamente quello che faccio.

Lavoro con ricercatori e team biotech su progetti di metagenomica, RNA-seq, sequenziamento dell’intero genoma e microbioma. Che tu abbia bisogno di analisi di amplicon 16S tramite QIIME2, espressione differenziale con DESeq2, clustering di singole cellule in Seurat o chiamata di varianti GWAS con GATK, gestisco l’intera pipeline dai raw reads alle figure pronte per la pubblicazione.

Ciò che ottieni da me:

Grafici volcano puliti, heatmap, visualizzazioni PCoA, UMAP a 300 DPI pronte per qualsiasi rivista. Una sezione metodi che puoi incollare direttamente nel tuo manoscritto. Analisi statistica fatta correttamente con correzione per test multipli. Codice documentato in modo che i tuoi risultati siano completamente riproducibili.

Accetto FASTQ, BAM, VCF, matrici di conteggio e numeri di accesso GEO o SRA da piattaforme Illumina, Nanopore o PacBio.

Ogni dataset racconta una storia. Lascia che ti aiuti a trovare la tua.

Scrivimi un messaggio con la tua domanda di ricerca e i dettagli dei dati, esaminerò il tuo progetto.