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Eseguirò simulazioni MD di proteine modificate e complessi di ligandi
Professore Associato di Chimica Fisica
Sono Ephriem Mengesha, PhD in Chimica Fisica e Professore Associato con oltre 15 anni di esperienza in ricerca e insegnamento. Offro servizi freelance in chimica computazionale, docking molecolare, sc...
Informazioni su questo servizio
Offro simulazioni dinamiche molecolari (MD) professionali usando Schrödinger Maestro (Desmond) per proteine, complessi proteina-ligando e proteine covalentemente modificate. I miei servizi includono preparazione del sistema, configurazione della simulazione, esecuzione di MD di produzione e analisi completa delle traiettorie (RMSD, RMSF, raggio di girazione, SASA, legami idrogeno, struttura secondaria e altro). Riceverai figure di qualità pubblicazione, file di simulazione e un rapporto scientifico chiaro per supportare la tua ricerca o sviluppo di prodotto.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Di quali informazioni hai bisogno per avviare il progetto?
Di solito ho bisogno della struttura della proteina (file PDB o ID PDB), struttura del ligando (se applicabile), dettagli di eventuali modifiche covalenti o mutazioni, i tuoi obiettivi di ricerca e la durata desiderata della simulazione. Se non sei sicuro, posso aiutarti a determinare la configurazione migliore.
Puoi simulare proteine chimicamente modificate o complessi covalenti proteina–ligando?
Sì. Posso modellare proteine covalentemente modificate.
Cosa riceverò alla fine del progetto?
Riceverai i file di input e output della simulazione, i file di traiettoria, grafici di analisi di qualità pubblicazione (come RMSD, RMSF, Rg, SASA e struttura secondaria) e un rapporto conciso che spiega i risultati e confronta la stabilità strutturale dei tuoi sistemi.
