Farò analisi rnaseq ngs dai raw reads all'espressione differenziale

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Farah Saleem

Pakistan

Parlo Urdu, Inglese

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Dove l'expertise nella ricerca incontra l'eccellenza nella scrittura accademica

Sono un bioinformatico, ricercatore e scrittore accademico con competenze avanzate in Python, C, C++ e sviluppo front-end (HTML, CSS, JavaScript, Bootstrap). La mia solida esperienza in data science, ...
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Informazioni su questo servizio

Fornisco analisi RNA-seq e NGS end-to-end, dai raw reads di sequenziamento ai risultati di espressione differenziale e visualizzazioni pronte per la pubblicazione.

Cosa consegno:

  • Controllo qualità e trimming dei reads (FastQC, fastp)
  • Allineamento/quantificazione (Salmon)
  • Analisi di espressione differenziale (DESeq2 in R)
  • Visualizzazioni: grafici volcano, PCA, heatmap
  • Analisi di pathway/enrichment (GO/KEGG) Pacchetto Premium
  • Modelli predittivi basati su ML sui dati di espressione Pacchetto Premium

Strumenti: Python, R, Salmon, DESeq2, tximport, ggplot2

Se hai bisogno dell'intero pipeline o di aiuto con una singola fase, ad esempio, hai già una matrice di counts e ti servono solo analisi di espressione differenziale e grafici, posso partire da dove si trova attualmente il tuo dato.

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do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression
Schermo intero
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Schermo intero
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