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Farò analisi RNA seq espressione genica arricchimento percorsi bioinformatica
Bioinformatico esperto, Multi Omics, Spatial Transcriptomic, Ricerca sul cancro con AI
Ciao, sono Frank Sani, scienziato di bioinformatica e specialista in ricerca AI con profonda esperienza in analisi di dati multi-omics, spatial transcriptomics, genomica del cancro e scrittura scienti...
Informazioni su questo servizio
Hai difficoltà a interpretare i tuoi dati RNA-seq? Eseguirò un'analisi completa, rigorosa e pronta per la pubblicazione sull'espressione genica, su misura per le tue esigenze di ricerca.
Cosa analizzo:
- Espressione genica differenziale (DESeq2, edgeR, limma)
- Analisi di arricchimento Gene Ontology (GO)
- Arricchimento di percorsi KEGG e Reactome
- Annotazione funzionale usando OMIM, GeneCards e UniProt
- Analisi dei promotori
- Analisi dei domini con InterProScan / Pfam
- Identificazione di omologhi con BLASTp
- Analisi di co-espressione (WGCNA)
- Visualizzazione
Tipi di dati con cui lavoro:
- Dataset RNA-seq di umani, piante e animali
- Dataset GEO, TCGA, NCBI, NGDC
- Elenco di geni ordinati, matrici di conteggio grezzo o file FASTQ
- Set di geni upregulated / downregulated
- Sperimentazioni multi-condizione e serie temporali
Le consegne includono:
- Rapporto completo di analisi
- Tabelle annotate di geni significativi
- Figure ad alta risoluzione
- Interpretazione biologica e discussione
- Contenuto scritto da umani, sicuro da strumenti di rilevamento AI
Sia che si tratti del tuo progetto di fine corso (FYP), capitolo di tesi di dottorato o articolo di ricerca, consegno lavori di qualità che rispettano gli standard accademici.
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
•
MATLAB
•
SQL
•
MLflow
Framework:
Scikit-learn
•
DeepPy
•
Google ML Kit
•
SimpleCV
•
PyTorch
FAQ
Traduzione automatica.
Puoi lavorare con specie di piante come Artemisia argyi?
Sì. Ho esperienza con specie di piante non modello, tra cui Artemisia argyi (genoma di riferimento NGDC/GWHBRAE). Posso mappare geni, estrarre sequenze CDS/proteine e eseguire tutte le analisi downstream.
Scrivi le sezioni metodi e risultati?
Sì. Tutti i pacchetti includono almeno la sezione Risultati. Standard e Premium comprendono sia Metodi che Risultati, scritti in inglese accademico, 100% scritti da umani e sicuri da Turnitin e rilevatori di AI.
In quale formato devo inviare i miei dati?
File Excel (.xlsx), CSV o di testo con ID di geni o valori di espressione. Lavoro con numeri di accesso GEO, download di dati TCGA o file condivisi tramite Google Drive o Dropbox.
I miei dati sono già pre-elaborati / ordinati. Questo influisce sul prezzo?
Dati pre-elaborati o ordinati possono ridurre i tempi di consegna. Contattami prima di ordinare e posso adattare il pacchetto per rispecchiare il tuo scopo esatto.
