Analizzerò dati rna seq a singola cellula usando r e seurat

Stai lavorando con dati di sequenziamento rna a singola cellula e hai bisogno di aiuto con il workflow di Seurat?

Offro analisi di rna-seq a singola cellula chiare e riproducibili usando R e Seurat. A seconda del pacchetto scelto, posso aiutarti con:

Controllo qualità e filtraggio delle cellule

Normalizzazione e selezione di caratteristiche variabili

PCA, UMAP, clustering e valutazione degli effetti batch

Analisi di geni marcatori e espressione differenziale

Annotazione di base del tipo di cellula usando marcatori noti

Grafici pronti per pubblicazioni come UMAP, violin, feature, dot e heatmap

Risoluzione di problemi con oggetti Seurat, assay, layer e errori di analisi

Riceverai codice R organizzato, risultati dell'analisi, figure e una spiegazione chiara del workflow. Mi concentro su analisi accurate, comunicazione trasparente e risultati comprensibili e riproducibili.

Nota bene: devi fornire una matrice di conteggio, una matrice di espressione processata o un oggetto Seurat. La lavorazione di FASTQ raw non è inclusa. L'annotazione delle cellule si basa su marcatori disponibili e informazioni di riferimento e dovrebbe essere validata biologicamente.

Contattami prima di ordinare per discutere la dimensione dei tuoi dati, la domanda di ricerca, i risultati attesi e i tempi.