Sfoglia categorie
Esplora
Fiverr Pro
Italiano
$
USD
Analizzerò i tuoi dati di rna seq a singola cellula e ti fornirò approfondimenti su misura
Codificando il futuro della biologia
Genyx LLC è una società biotech, di bioinformatica e di software basato su AI che sviluppa soluzioni di nuova generazione per genomica, sanità e scienze della vita. Siamo specializzati in analisi NGS,...
Informazioni su questo servizio
Offro analisi personalizzate di rna-seq a singola cellula adattate al tuo dataset e agli obiettivi di ricerca. Ogni progetto viene personalizzato in base alla domanda biologica, applicando workflow riproducibili in R o Python (Seurat, Scanpy, ecc.) per fornire risultati di alta qualità e interpretabili.
I servizi includono:
- Controllo qualità e filtraggio
- Normalizzazione, scaling e riduzione della dimensionalità (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clustering e identificazione di geni marcatori
- Annotazione opzionale del tipo cellulare e arricchimento di pathway
- Generazione di visualizzazioni pronte per pubblicazione e report riepilogativi
Con oltre quattro anni di esperienza in bioinformatica e in molte discipline omiche, garantisco che ogni analisi sia robusta, trasparente e biologicamente significativa. Per favore contattami prima di ordinare per discutere i tuoi dati e gli obiettivi dell'analisi.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Che tipo di dati posso fornire?
Puoi fornire file FASTQ grezzi (per l'elaborazione con Cell Ranger o equivalente) o matrici di conteggio processate (ad esempio .mtx, .h5 o .csv). Adatterò il workflow in base al tipo di dati e agli obiettivi del progetto.
Esegui l'elaborazione dei dati grezzi (FASTQ a matrice di conteggio)?
Sì. Questo passaggio può essere aggiunto come servizio extra e include l'allineamento delle reads, il conteggio degli UMI e la generazione della matrice di espressione adatta all'analisi downstream.
Quali strumenti utilizzi per l'analisi?
Utilizzo principalmente Seurat, Scanpy, Monocle3 e Cell Ranger, insieme ai pacchetti standard di R e Python per visualizzazione e analisi di arricchimento.
Puoi integrare più campioni o batch?
Sì. La correzione dei batch e l'integrazione di più campioni possono essere incluse come opzione aggiuntiva. Uso Seurat v4, Harmony o Scanorama a seconda delle caratteristiche del dataset
Come discutiamo la domanda biologica o il piano di analisi?
Prima di iniziare, scambieremo alcuni messaggi per definire i tuoi obiettivi principali e i dettagli dei dati. Poi confermerò il pacchetto migliore o suggerirò un'offerta personalizzata se necessario.
