Scaricherò e allineerò i tuoi campioni fastq al genoma

I dati pubblici di microarray o RNAseq sono davvero utili per diversi tipi di analisi. Questi file sono molto pesanti e serve un'infrastruttura computazionale potente per ottenerli. Usando un HPC Linux, scaricherò tutti i tuoi dati (campioni fastq) da database pubblici come SRA, ENA, NIH, ecc. Li allineerò al genoma (umano, topo, zebrafish...) usando STAR o Salmon aligner, e ti fornirò i conteggi grezzi con cui potrai fare analisi downstream.

Inoltre, ti fornirò un report html con le metriche, le statistiche e i passaggi di controllo qualità dei campioni allineati.

Ogni campione costerà 5$

Se hai domande, scrivimi e ne parleremo!