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Scaricherò e allineerò i tuoi campioni fastq al genoma
Come ricercatore con Ph.D. al National Cancer Research Center, mi specializzo in analisi bioinformatiche avanzate, soprattutto in aree chiave come RNA-seq, CRISPR-Screening, single-cell RNA-seq, trans...
Livello 1
Ha soddisfatto determinati criteri di prestazione e mostra un forte potenziale nel marketplace.
Informazioni su questo servizio
I dati pubblici di microarray o RNAseq sono davvero utili per diversi tipi di analisi. Questi file sono molto pesanti e serve un'infrastruttura computazionale potente per ottenerli. Usando un HPC Linux, scaricherò tutti i tuoi dati (campioni fastq) da database pubblici come SRA, ENA, NIH, ecc. Li allineerò al genoma (umano, topo, zebrafish...) usando STAR o Salmon aligner, e ti fornirò i conteggi grezzi con cui potrai fare analisi downstream.
Inoltre, ti fornirò un report html con le metriche, le statistiche e i passaggi di controllo qualità dei campioni allineati.
Ogni campione costerà 5$
Se hai domande, scrivimi e ne parleremo!
Tecnologia:
Python
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RStudio
•
Altro
Tipo di informazioni:
Listing
•
Altro
Tecnica:
Manuale
