Costruirò una pipeline automatizzata per l'analisi delle sequenze fasta in bash e python

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passando alla bioinformatica

Attualmente sto sviluppando competenze nei flussi di lavoro del terminale Linux, nei database NCBI/EMBL-EBI e nell'analisi delle sequenze. 🎯 Mira a contribuire a strumenti di bioinformatica open-sour...
Informazioni su questo servizio

Stai cercando una pipeline automatizzata affidabile e ad alta velocità per elaborare sequenze biologiche FASTA senza lavoro manuale? 


Sono specializzato nella creazione di pipeline modulari e riproducibili in Bash e Python, pensate per l'estrazione di sequenze FASTA da NCBI e l'analisi bioinformatica a valle.


### Cosa offro in questo servizio:

- Recupero automatico di sequenze NCBI: download batch di sequenze FASTA usando gli ID di accesso.

- Statistiche e metriche delle sequenze: calcolo della lunghezza totale, percentuali di GC/AT e statistiche N50.

- Profilazione GC a finestra: analisi dettagliata del contenuto di GC su finestre scorrevoli.

- Manipolazione delle sequenze: generazione automatica di reverse complement e pulizia degli header FASTA.

- Esportazione di dati strutturati: report TSV/CSV puliti per analisi a valle.


### Perché scegliere il mio servizio?

- Codice pulito e ben documentato: script modulari in Bash e Python progettati per una facile riutilizzabilità.

- Workflow ottimizzati per lo storage: esecuzione efficiente da riga di comando su ambienti Linux.

- Consegna rapida e supporto completo: istruzioni dettagliate per un'esecuzione senza problemi sul tuo terminale.


Sentiti libero di inviarmi un messaggio con le tue esigenze specifiche prima di effettuare un ordine!

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