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Fornirò servizi di docking e simulazione md
DockVision
Level 2
5,0
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Informazioni su questo servizio
Traduzione automatica.
DockVision è più di un semplice servizio freelance. La maggior parte dei venditori può offrire servizi di bioinformatica. La vera differenza sta nel sapere quale metodo usare, come progettare correttamente il workflow e come trasformare l'output computazionale grezzo in risultati scientificamente significativi. È qui che la mia esperienza si distingue.
Sono uno scienziato computazionale con più di 5 anni di esperienza pratica e più di 100 progetti completati per clienti in oltre 30 paesi. Gestisco workflow di ricerca complessi che vanno oltre il semplice esecuzione di software e la consegna di output di base.
Le mie competenze includono:
- Docking di proteine-ligandi
- Docking di proteine-proteine
- Docking di proteine-DNA/RNA
- Docking di ioni metallici
- Docking di nanoparticelle
- Docking di peptidi
- Simulazioni di membrane
- Simulazioni di acidi nucleici
- Simulazioni di peptidi/polimeri
- Simulazioni MD con campionamento avanzato
Analisi post-simulazione:
- MM/PBSA & MM/GBSA
- PCA/DCCM/FEL
- SASA & Rg
- Analisi dei legami H
- Analisi di clustering
- Analisi delle interazioni protein-ligando
- Analisi della struttura secondaria
- Analisi della mappa di contatto
- Analisi di distanza e angolo
- Interazioni tra residui
Il mio obiettivo è fornire analisi scientificamente solide, riproducibili, con interpretazioni chiare, visualizzazioni di qualità pubblicazione e risultati ben organizzati.
Scopri di più su DockVision
DockVision
Computational Biologist and Data Scientist
Level 2
- DaPakistan
- Membro daago 2022
- Tempo di risposta medio1 ora
- Ultima consegna1 settimana
Lingue
Inglese, Spagnolo, Tedesco, Francese, Italiano
A bio-technologist specializing in bioinformatics, computational biology, and in-silico drug discovery.
As founder of DockVision, I lead a consultancy delivering precision-engineered research solutions worldwide. With five years of excellence and 90+ projects across 30+ countries, our team executes end-to-end computational pipelines upholding the highest standards of scientific rigor and turning complex molecular challenges into publication-ready insight.
Traduzione automatica.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Sei un esperto bioinformatico?
Sì, ho oltre 5 anni di esperienza professionale in bioinformatica, lavorando con successo su docking molecolare, simulazioni di dinamica molecolare e progetti di ricerca computazionale avanzata per clienti internazionali.
È possibile prevedere gli obiettivi dei farmaci?
Sì, lavoro con dati di sequenza. A seconda delle esigenze del cliente, posso prevedere i candidati per i target dei farmaci e anche lo screening virtuale dei farmaci è un'opzione.
Il prezzo è lo stesso per tutte le attività menzionate in servizio?
No, non è lo stesso per tutti i progetti, dipende dal progetto e dalla sua estensione.
Di quali informazioni hai bisogno per avviare il progetto?
Ho bisogno della struttura della proteina (ID PDB o file), della struttura del ligando/peptide e di obiettivi chiari del progetto.
Quale software usi?
Lavoro con AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, HADDOCK, GROMACS, NAMD, ACEMD, Desmond, VMD, PyMOL, ChimeraX, CHARMM-GUI, AmberTools, PLUMED, Python, R, Bash/Linux, Claude Code, Cursor, Jupyter e librerie Python come MDAnalysis, MDTraj, ProDy, Biopython, NumPy, Pandas, Matplotlib e SciPy.
Quanto durano le simulazioni MD che esegui?
Di solito tra 50 e 500 ns, a seconda delle esigenze del progetto. Si possono organizzare simulazioni più lunghe se necessario.
Puoi aiutare con l'interpretazione dei risultati?
Sì, fornisco interpretazioni scientifiche chiare per aiutarti a capire se il tuo complesso è stabile e promettente.
Il tuo lavoro è adatto per la pubblicazione?
Sì, le analisi e i rapporti sono preparati secondo gli standard accademici e di ricerca.
Quali analisi sono incluse dopo la simulazione MD?
RMSD, RMSF, raggio di gyration, analisi dei legami idrogeno, SASA, stabilità dell'interazione e energia di binding libera (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, analisi di cluster e molte altre.
Puoi eseguire screening virtuale di grandi librerie di composti?
Sì, posso esaminare più composti e classificarli in base all'affinità di binding e alla qualità dell'interazione.
Recensioni
55 recensioni per questo servizio
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Valutazione dettagliata
- Livello di comunicazione del venditore
- Qualità della consegna
- Valore della consegna
Ordina per
Più rilevante
M maalotaibi
Arabia Saudita
Collaborazione in corsoThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
200 USD-400 USD
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6 giorni
Tempo
Utile?J joy_hj
Stati Uniti
Collaborazione in corsonice work N
200 USD-400 USD
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5 giorni
Tempo
Utile?J joy_hj
Stati Uniti
Collaborazione in corsogrt work and fast
50 USD-100 USD
$
2 giorni
Tempo
Utile?A aashamrani
Arabia Saudita
Collaborazione in corsooutstanding effort and truly excellent work.
400 USD-600 USD
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9 giorni
Tempo
Utile?J just_som_motion
Italia
Collaborazione in corsoOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
50 USD-100 USD
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Risposta del venditore
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Collaborazione in corsoOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
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