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Farò docking molecolare e simulazioni MD
Bioinformatico
Sono un bioinformatico con 8 anni di esperienza nella ricerca e ho pubblicato lavori in riviste di alto livello come Microbial Pathogenesis, Biomedicines e Scientific Reports. Su Fiverr offro supporto...
Informazioni su questo servizio
Come fondatore e CEO di DockDynamics, offro simulazioni di docking molecolare e dinamica molecolare (MD) di livello esperto per supportare progetti di scoperta di farmaci computazionale. Se cerchi un esperto nella progettazione di farmaci, sei nel posto giusto. Ti aiuterò con progetti legati alla progettazione di farmaci e vaccini. Come bioinformatico professionista, fornisco risultati riproducibili, affidabili e pronti per la pubblicazione.
Strumenti e risorse:
Docking proteina-ligando (AutoDock Vina, PyRx, MOE)
Simulazioni MD (GROMACS/AMBER/NAMD)
Analisi di interazione e stabilità (RMSD, RMSF, Rg, SASA, PCA, DCCM, MMGBSA)
Calcoli energetici e visualizzazioni (PyMOL, Chimera, Discovery Studio, LigPlus)
Analisi ADMET e RO5 (SwissADME, AdmetSAR, ProTox-II)
Include report dettagliati, grafici e script riproducibili (su richiesta).
Perché scegliermi?
1. Consegna rapida dell'ordine
2. Revisioni
3. Soddisfazione del cliente al 100%
4. Garanzia di rimborso completo
5. Tariffe accessibili
Sentiti libero di contattarmi per personalizzare l'ordine.
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
Tecnologia:
Excel
•
Fogli Google
•
SPSS
Expertise:
Predizione
•
probabilità
•
Statistiche
•
Metodo Monte Carlo
Strumenti:
RStudio
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Quali file di input hai bisogno da me?
Di solito, ho bisogno della tua struttura proteica (formato PDB) e del/i ligando/i in formato MOL2/SDF/PDBQT.
Quale software utilizzi?
Utilizzo AutoDock Vina, PyRx, MOE per il docking, e NAMD, GROMACS (o AMBER su richiesta) per le simulazioni MD. Le visualizzazioni vengono create con PyMOL, Chimera o VMD.
Puoi eseguire simulazioni per qualsiasi proteina target?
Sì, purché sia disponibile una struttura 3D valida (PDB o modello di omologia), posso eseguire docking e simulazioni MD.
Riceverò un rapporto?
Sì, ogni pacchetto di simulazione include un rapporto PDF dettagliato con metodi, risultati, grafici (ad esempio RMSD, RMSF) e visualizzazioni dell'interazione.
Questi risultati sono adatti per pubblicazioni o tesi?
Assolutamente, fornisco visualizzazioni e dati pronti per la pubblicazione.
I miei dati vengono mantenuti riservati?
Sì. I tuoi dati sono completamente riservati e firmo un accordo di non divulgazione (NDA) se richiesto.
