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Bioinformatica semplificata
Ciò che è incluso:
ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run / Tag
Controllo qualità approfondito
Allineamento + chiamata dei picchi (Bowtie2/MACS3/SEACR)
Picchi di consenso, sovrapposizioni e segnale.
Analisi dei picchi differenziali (DiffBind)
Visualizzazione: PCA, grafico a volcano interattivo.
Annotazione dei picchi genomici (ChIPseeker)
Annotazione funzionale dei picchi (ENCODE-SCREEN)
Tracciati genomici per visualizzazione (BigWig)
Rapporto QC
Rapporto tecnico
Traduzione automatica.
Quanti campioni sono inclusi?
Fino a 6 campioni.