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Eseguirò analisi epigenetica integrativa
Bioinformatica semplificata
Lead Analyst presso INTEGRATIVE BIOANALYTICS.
Sono un bioinformatico principale e ex scienziato di laboratorio umido al Dana-Farber Cancer Institute e UT Southwestern. Le mie priorità sono rigore sci...
Informazioni su questo servizio
Cosa è incluso:
ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run/Tag
Controllo qualità approfondito
Allineamento + chiamata dei picchi (Bowtie2/MACS3)
Punteggi di consenso, sovrapposizioni e segnale.
Analisi dei picchi differenziali (DiffBind)
Visualizzazione: PCA, grafico a volcano interattivo.
Annotazione dei picchi genomici (ChIPseeker)
Annotazione funzionale dei picchi (ENCODE-SCREEN)
Tracciati genomici per visualizzazione (BigWig)
Annotazione personalizzata con dataset di interesse.
Footprinting proteico basato su evidenze (LOLA/ReMap2022)
Analisi di motivi noti e de novo (HOMER)
Analisi delle vie metaboliche basata su domini regolatori (GREAT)
Relazione biologica
Relazione QC
Relazione tecnica
Revisioni minori e consulenza.
FAQ
Traduzione automatica.
Quanti campioni sono inclusi?
Fino a 6 campioni.
