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Analizzerò i dati del sequenziamento dell'immunocettore tcr bcr
Soluzioni semplici per dati biomedici complessi
Ciao, mi chiamo Jonathan Alles. Sono un consulente indipendente di bioinformatica e ingegneria dei dati. Attraverso la mia agenzia, EVOBYTE Digital Biology, supporto i professionisti nell'ingegneria e...
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno di supporto nell'analizzare, integrare o interpretare i dati di sequenziamento immunorecettori, da assay (single cell) TCR o BCR-seq?
Ciò che offro:
Analisi bioinformatica
- Elaborazione bioinformatica dei dati grezzi di sequenziamento
- Aggregazione, filtraggio, pulizia
- Annotazione dei metadati
- Allineamento e quantificazione delle sequenze TCR/BCR
- Statistica sull'uso dei geni e confronto statistico
- Tracking TCR/BCR
- Clustering dei recettori
- Integrazione con fonti di dati pubbliche (ad esempio VDJ-DB)
Visualizzazione & Reporting
- Notebook Jupyter con codice di analisi
- Report personalizzati in PDF o HTML
- Pannelli di controllo per query sui dati
Sviluppo di pipeline & automazione
- Automazione e scalabilità delle pipeline di analisi
- Integrazione con database e cloud
- Containerizzazione
Curazione dei dati
- Curazione e assemblaggio di pacchetti di dati da letteratura o repository pubblici
Stack tecnologico
Python / Pandas / scipy / Jupyter / TF / Bash / MiXCR / Pacchetti Python per bioinformatica TCR/BCR
Costruiamo insieme!
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