Analizzerò i dati di RNA seq e trascrittomica spaziale delle singole cellule

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Parlo Tedesco, Inglese

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Soluzioni semplici per dati biomedici complessi

Ciao, mi chiamo Jonathan Alles. Sono un consulente indipendente di bioinformatica e ingegneria dei dati. Attraverso la mia agenzia, EVOBYTE Digital Biology, supporto i professionisti nell'ingegneria e...
Informazioni su questo servizio

Hai bisogno di supporto nell'analisi, integrazione o interpretazione di dati omici a singola cellula?

Sostengo i team di ricerca nell'analisi dei dati per scRNA-Seq, recettori immuni a singola cellula o analisi omiche spaziali.


Analisi personalizzate sono possibili: contattami per un preventivo.


Cosa offro:

Analisi bioinformatica

  • Elaborazione bioinformatica dei dati di sequenziamento grezzi
  • Aggregazione, filtraggio, pulizia, correzione batch
  • Ingestione di metadata
  • Clustering e annotazione dei cluster
  • Espressione genica differenziale
  • Inferenza delle traiettorie
  • Analisi GSEA / GO Term
  • Analisi della vicinanza spaziale

Visualizzazione & Reporting

  • Notebook Jupyter con codice di analisi
  • Report personalizzati in PDF o HTML
  • Pannelli di controllo per interrogare i dati

Sviluppo pipeline & automazione

  • Automazione e scalabilità delle pipeline di analisi
  • Integrazione con database e cloud
  • Containerizzazione

Curazione dei dati

  • Raccolta di dati omici (single-cell) per indicazioni specifiche, modalità terapeutiche, specie,...
  • Estrazione di dati da fonti pubbliche e database e restituzione di dataset integrati


Stack tecnologico

Python / Pandas / scVerse / scipy / Jupyter / TF / Bash / Cell Rank / squidpy / scVelo


Costruiamo insieme!

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Linguaggio di programmazione:

Python

Tecnologia:

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Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

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    Extremely knowledgeable researcher with a high quality of work and professionalism. Reliable data analysis with easy to observe and digest results. Highly recommend.

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    Jonathan Alles is an outstanding professional in the field of Data Analytics. His meticulous attention to detail, unwavering professionalism, and exemplary responsiveness greatly contributed to a smooth and efficient collaboration. The quality of his work is exceptional, and I would unreservedly recommend...

    600 USD-800 USD

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    3 settimane

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