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Analizzerò dati di trascrittomica del cancro pubblici TCGA GEO e altri
Dottore in Bioinformatica, RNA seq, Genomica, Biostatistica, R e Python
Sono un bioinformatico con un dottorato in Bioinformatica e oltre 11 anni di esperienza in biologia computazionale. Uso R e Python per analisi di bulk e single-cell RNA-seq, ATAC-seq, WGS/WES, analisi...
Livello 1
Ha soddisfatto determinati criteri di prestazione e mostra un forte potenziale nel marketplace.
Informazioni su questo servizio
Analizzo dataset di trascrittomica del cancro pubblici provenienti da TCGA, GEO e repository di ricerca simili.
I servizi possono includere revisione del dataset e dei metadati, preprocessing dell'espressione, espressione differenziale, analisi di sopravvivenza, associazioni con variabili cliniche, correlazione genica, arricchimento di pathway, confronti tra sottogruppi immunitari o molecolari e validazione tra coorti. Il flusso di lavoro sarà adattato alla domanda di ricerca e alle informazioni disponibili in ogni dataset.
Riceverai le figure e le tabelle di risultato concordate, codice R o Python riproducibile dove applicabile, e un'interpretazione concisa che evidenzia i principali risultati e le limitazioni.
Questo servizio è destinato esclusivamente a scopi di ricerca e formazione. Non fornisce diagnosi cliniche, raccomandazioni terapeutiche o interpretazioni mediche specifiche per il paziente.
Contattami prima di ordinare indicando il tipo di cancro, l'accesso al dataset o lo studio, i geni o i pathway di interesse, le comparazioni pianificate e i risultati richiesti.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Puoi aiutare a scegliere un dataset TCGA o GEO adatto?
Sì. Inviami il tipo di cancro, la domanda biologica, i requisiti del campione e il tipo di dato preferito così posso valutare le coorti pubbliche più adatte.
Quali analisi possono essere incluse?
L'ambito può includere espressione differenziale, analisi di sopravvivenza, correlazione, arricchimento, confronto tra sottogruppi, associazioni con variabili cliniche e validazione tra coorti.
Riceverò il codice dell'analisi?
Sì, quando il codice è incluso nel pacchetto scelto. Posso fornire script riproducibili in R o Python, notebook e tabelle di risultato.
Fornisci interpretazioni cliniche?
No. Questo servizio fornisce analisi bioinformatiche di ricerca e non include diagnosi, consigli terapeutici o interpretazioni mediche specifiche per il paziente.
