Eseguirò analisi rnaseq, atacseq o scrnaseq con bioinformatica completa

Stai cercando un'analisi pulita, approfondita e riproducibile dei tuoi dati di sequenziamento?

Sono specializzato in analisi di dati ad alta produttività, tra cui RNA-seq, ATAC-seq e single-cell RNA-seq (scRNA-seq). Che tu abbia campioni bulk o dataset complessi di singole cellule, posso offrire una pipeline completa dalla qualità dei dati all'analisi avanzata a valle.

Offro:

• Controllo qualità (FastQC, MultiQC)
• Allineamento e quantificazione
• Analisi di espressione/dotabilità differenziale
• Chiamata di picchi (per ATAC-seq)
• Riduzione della dimensionalità, clustering, tipizzazione cellulare (per scRNA-seq)
• Visualizzazione (heatmap, PCA, volcano plot, UMAP/tSNE)
• Arricchimento funzionale (GO/KEGG)
• Grafici personalizzati per pubblicazioni

Strumenti che utilizzo: R, Seurat, DESeq2, edgeR, MACS2, Galaxy, Bioconductor, Scanpy

Trasformiamo i tuoi dati grezzi in intuizioni biologiche!