Analizzerò i tuoi dati rnaseq con deseq2 e figure pronte per la pubblicazione

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Pakistan

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Bioinformatico specializzato in RNA seq e analisi di Single Cell, analista di bioinformatica

Ciao, sono Maaz, un ricercatore in biotecnologie di Karachi con esperienza pratica in bioinformatica. Costruisco pipeline riproducibili e trasformo dati di sequenziamento grezzi in risultati chiari e ...
Informazioni su questo servizio

Hai dati RNA-seq ma nessun tempo (o pipeline) per analizzarli? Trasformerò i tuoi conteggi o reads grezzi in risultati chiari e pronti per la pubblicazione. Sono un ricercatore in biotecnologie con esperienza pratica in laboratorio e un portfolio pubblico su GitHub, che include una pipeline RNA-seq (HISAT2, featureCounts, DESeq2) su cellule muscolari lisce delle vie aeree trattate con desametasone.

COSA OTTIENI - Analisi di espressione differenziale con DESeq2 - QC, PCA, grafici a volcano e heatmap - arricchimento di pathway GO/KEGG (Standard e Premium) - Tabelle di risultati pulite (Excel/CSV) - codice riproducibile e README

COSA MI SERVE DA TE - Matrice di conteggi grezzi o file FASTQ - Metadati dei campioni (gruppi/condizioni) - Organismo e genoma di riferimento - Confronti desiderati (ad esempio, trattato vs controllo)

PERCHÉ LAVORARE CON ME - Comunicazione chiara e consegna puntuale - Figure formattate per articoli e presentazioni - I tuoi dati rimangono riservati Non sei sicuro di quale pacchetto sia il più adatto? Scrivimi prima di ordinare con una breve descrizione del tuo esperimento e ti consiglierò l'opzione migliore.

Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

•

Analisi qualitativa

Expertise:

Statistiche

•

Analisi dei cluster

•

Test di regressione

Tecnologia:

Excel

•

MATLAB

Linguaggio di programmazione:

Python

•

R

Il mio portfolio