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Analizzerò dati bulk rna seq e espressione genica
Analista di bioinformatica RNA seq Visualizzazione scientifica dei dati
Analista di bioinformatica specializzato in bulk RNA-seq umano, analisi dell'espressione genica e visualizzazione di dati scientifici. Aiuto i ricercatori a trasformare le matrici di conteggio e i met...
Informazioni su questo servizio
Trasforma i tuoi dati di RNA-seq bulk umano o di espressione genica in risultati chiari, affidabili e pronti per la pubblicazione.
Aiuto ricercatori, laboratori e team biotech a trasformare matrici di espressione complesse in approfondimenti biologici ben organizzati usando workflow di R e Bioconductor su misura per ogni studio.
Le servizi possono includere:
- Controlli di input, metadati e identità dei campioni
- Controllo qualità, revisione della dimensione della libreria, PCA e diagnosi dei campioni
- Filtraggio, normalizzazione e analisi di espressione differenziale
- Tabelle di risultati complete, volcano plot e figure pronte per la pubblicazione
- Heatmap di DEG e analisi di pathway GO, Reactome e KEGG
- Analisi di sensibilità e concordanza per progetti avanzati
- Metodi chiari, riepilogo dei risultati e registri di QA strutturati
Riceverai output accuratamente organizzati, facili da rivedere, interpretare e usare in report, presentazioni, manoscritti o analisi successive. Mi concentro sulla chiarezza statistica, visualizzazioni di alta qualità e comunicazione trasparente durante tutto il progetto.
Contattami prima di ordinare così posso capire i tuoi dati, la domanda di ricerca e le comparazioni desiderate.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Quali file devo fornire?
Per favore, fornisci una matrice di conteggio o espressione a livello genico, metadati dei campioni, etichette di gruppo, tipo di ID genico e le comparazioni di cui hai bisogno. Una breve descrizione della tua domanda di ricerca è anche utile.
Processi i file FASTQ grezzi?
Questo Gig si concentra sull'analisi downstream di matrici di conteggio a livello genico o matrici di espressione validate. Il controllo qualità dei FASTQ grezzi, l'allineamento e la quantificazione richiedono un scope personalizzato separato.
Quale pacchetto devo scegliere?
Il pacchetto base copre il controllo qualità focalizzato e l'espressione differenziale. La versione standard aggiunge diagnosi, heatmap di DEG e analisi di pathway. La versione premium supporta studi più grandi, fino a due confronti, analisi di sensibilità e QA ampliato.
Sono inclusi script R o Python?
Gli script e i notebook riproducibili in R o Python non sono inclusi di default. Possono essere forniti come extra personalizzato a pagamento dopo aver revisionato i dati, l'ambiente e lo scope di codice richiesto.
Puoi analizzare studi con disegni complessi o accoppiati?
Sì, confronti semplici accoppiati e non sono supportati nel pacchetto appropriato. Disegni multifattoriali, di interazione, longitudinali o altri complessi richiedono una revisione di fattibilità e un'offerta personalizzata.
Puoi garantire geni o pathway significativi?
La significatività statistica dipende dai dati, dalla dimensione del campione e dall'effetto biologico. Fornisco risultati completi e trasparenti, riportando chiaramente sia i risultati significativi che quelli non significativi.
Cosa riceverò?
A seconda del pacchetto, riceverai tabelle di risultati organizzate, figure ad alta risoluzione, metodi, riepilogo dei risultati e registri di QA. I pacchetti avanzati includono analisi di pathway e sensibilità.
Cosa è coperto da una revisione?
Una revisione copre correzioni, modifiche di formattazione o chiarimenti all’interno dello scope di analisi concordato. Nuovi dataset, confronti, metodi o moduli di analisi richiedono un extra o un’offerta personalizzata.
