Annoterò genomi di phage e proteine di phage

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Ciao! Sono Manjunath, laureato in Biologia Molecolare con esperienza pratica in microbiologia, ricerca sui batteriofagi e biologia molecolare. Ho esperienza nell'analisi del genoma, annotazione dei ge...

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Informazioni su questo servizio

Annotazione di genomi di phage e proteine

Hai sequenze di un genoma di batteriofago o proteine che necessitano di un'annotazione bioinformatica professionale? Posso aiutarti a identificare geni, prevedere funzioni proteiche e caratterizzare il tuo genoma di phage usando strumenti e database bioinformatici consolidati.

I servizi includono:

Annotazione del genoma di phage e previsione ORF/CDS

Chiamata di geni e annotazione funzionale

Previsione della funzione delle proteine di phage

Analisi di similarità basata su BLAST

Identificazione di domini conservati e famiglie di proteine

Identificazione di proteine strutturali, di replicazione, di lisi e di metabolismo del DNA

Caratterizzazione di proteine ipotetiche

Identificazione di tRNA e altre caratteristiche genomiche

Analisi comparativa dei genomi di phage

Mappe genomiche e tabelle di annotazione

Strumenti/Database: NCBI BLAST, HMMER, Pfam, InterPro, UniProt, PHROGs, Prokka, PHANOTATE, VIBRANT e altre risorse pertinenti.

Risultati consegnabili: genoma annotato, tabella di annotazione delle proteine, classificazione funzionale, risultati dell'analisi, riepilogo delle caratteristiche del genoma e figure/tabelle pronte per pubblicazione, dove applicabile.

Contattami prima di ordinare per discutere il tuo genoma, sequenze di proteine o requisiti di ricerca specifici.

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