Eseguirò docking molecolare e analisi di simulazione MD

Hai bisogno di un docking molecolare o di una simulazione MD eseguiti con precisione, con risultati che puoi effettivamente interpretare e difendere?

Ho una laurea magistrale in Virologia Molecolare e una laurea triennale in Bioinformatica. Il mio lavoro di tesi ha coinvolto screening virtuale, docking molecolare e simulazioni di dinamica molecolare per valutare inibitori candidati contro bersagli proteici rilevanti per le malattie, quindi capisco la biologia dietro ai numeri, non solo come far funzionare il software.

Strumenti con cui lavoro:

• AutoDock Vina, Discovery Studio (docking molecolare e screening virtuale)
• GROMACS (simulazioni di dinamica molecolare)
• PyMOL e UCSF Chimera, Chimera X (visualizzazione strutturale)

Offro:

• Screening virtuale di librerie di composti contro un bersaglio
• Docking proteina-ligando con visualizzazione della posa di binding
• Analisi di interazioni 2D e 3D
• Simulazione MD (tipicamente fino a 10-20 ns) con analisi RMSD, RMSF, H-bond e raggio di gyration
• Rapporto scritto chiaro che spiega metodologia e risultati

Contattami prima di ordinare per discutere del tuo bersaglio, ligando(i) e quale pacchetto si adatta al tuo progetto. Sistemi più grandi o simulazioni più lunghe possono essere discussi come ordine personalizzato.