Oltre 3 anni di esperienza specializzata in genomica batterica, bioinformatica e integrazione AI/ML
Creazione di pipeline end-to-end per assemblaggio, annotazione e genomica comparativa del genoma batterico
Competenza pratica con strumenti come BLAST, MEGA, iTOL, BPGA e database come NCBI, EnsemblBacteria
Servizi offerti analisi del genoma batterico
- Analisi completa del genoma batterico utilizzando BLAST, MEGA, iTOL e strumenti pan-genoma (ad esempio BPGA)
- Costruzione e annotazione di alberi filogenetici e visualizzazione con iTOL
- Profilazione del pan-genoma (analisi di geni core, accessori e unici) tra più ceppi batterici
- Integrazione e analisi di dataset GEO per la trascrittomica batterica
- Analisi di arricchimento GO/KEGG per l'interpretazione funzionale dei set di geni batterici
- Sviluppo di pipeline ML personalizzate per identificare biomarcatori, geni di resistenza o pattern evolutivi
- Pipeline scalabili per genomica comparativa, scoperta di bersagli farmacologici e classificazione microbica