Mi occuperò del lavoro noioso di bioinformatica

Il lavoro di bioinformatica ha molte fasi di esecuzione noiose che non si vedono nella sezione metodi di un articolo, ma che ti fanno perdere ore:

- Eseguire QC sui file di sequenziamento grezzi e interpretare il report

- Districarsi tra nomi di file disordinati su decine o centinaia di campioni

- Risolvere un passaggio della pipeline che continua a fallire (Snakemake, Nextflow o uno script personalizzato) a causa di mismatch di formato o problemi di ambiente

- Formattare i metadati per la submission a GEO/SRA

- Cross-referenziare una lista di geni/variante con database e compilare un riepilogo pulito e annotato

Questo è il lavoro di fatica che è facile da descrivere ma noioso e soggetto a errori da eseguire, soprattutto con file reali, disordinati e di grandi dimensioni. Ho esperienza pratica nell'esecuzione di questi strumenti e nella risoluzione dei casi limite inevitabili.

Dimmi cosa si rompe o cosa bisogna fare, e inviami un esempio dei tuoi dati. Ti dirò esattamente cosa posso consegnare e quanto velocemente.