Analizzerò i dati bioinformatici di rna seq single cell e atac seq

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Bioinformatico e ingegnere ML RNA seq scRNA seq ATAC seq

Ingegnere di bioinformatica e machine learning specializzato in RNA seq, single cell RNA seq, ATAC seq, genomica e analisi di dati biologici. Trasformo dati di sequenziamento grezzi in risultati pulit...
Informazioni su questo servizio

Hai bisogno di analizzare dati RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq o multi-omics in modo chiaro e riproducibile?


Posso aiutarti con il controllo di qualità, preprocessing, normalizzazione, analisi di espressione differenziale, clustering, geni marker, analisi di pathway/enrichment, interpretazione di picchi/count ATAC, visualizzazione e un breve riassunto dei risultati.


Gli strumenti e i workflow possono includere R, Python, Bioconductor, DESeq2, Seurat, Scanpy, Jupyter, RStudio e Google Colab.


Le consegne tipiche includono tabelle di risultati pulite, grafici in stile pubblicazione, codice o notebook riproducibili in R/Python e interpretazioni concise dei principali risultati.


Per favore, inviami un messaggio prima di ordinare così posso confermare il tipo di dati, i metadati del campione, i gruppi di confronto, l'organismo/genoma di riferimento e l'output atteso.



Linguaggio di programmazione:

Python

R

Tecnologia:

Quaderno jupyter

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Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

analisi statistica

Expertise:

Progettazione esperimenti

Algoritmi

Statistiche

Strumenti:

RStudio

Google Colab

Altro