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Eseguirò analisi di genomica e mutazioni su larga scala per il cancro
Sblocca approfondimenti genomici con analisi esperta di dati NGS, analisi di imaging medico
Analista di bioinformatica e imaging medico con competenze in analisi di mutazioni tumorali NGS, Bulk RNA-Seq, scRNA-Seq, profili di espressione genica, analisi di pathway, identificazione di tumori c...
Informazioni su questo servizio
Se hai bisogno di supporto per un progetto di ricerca, tesi, manoscritto, proposta di finanziamento o indagine biotecnologica, posso offrire analisi di genomica del cancro affidabili e riproducibili.
Sono un ricercatore in bioinformatica con competenze in genomica del cancro, NGS e analisi multi-coorte su larga scala. Ti aiuterò ad analizzare le mutazioni somatiche dai dataset del genoma del cancro utilizzando workflow di bioinformatica all'avanguardia.
Servizi offerti:
- Analisi dei dati NGS.
- Profilazione delle mutazioni attraverso coorti di cancro
- Identificazione di geni driver
- Analisi di geni significativamente mutati
- Sviluppo di pipeline personalizzate usando R, Perl, Java e Linux shell
- Analisi della frequenza delle mutazioni
Perché scegliermi?
- PhD in Bioinformatica
- Pubblicazioni su riviste di alto impatto (NAR, BMC)
- Professionale e puntuale nella consegna.
Strumenti e tecnologie
- Samtools, Bedtools
- Controllo qualità (FastQC, MultiQC)
- Trimming delle reads (Trimmomatic, Cutadapt)
- Allineamento (BWA, Bowtie2, STAR, HISAT2)
- Chiamata di varianti (GATK, FreeBayes, DeepVariant)
- Annotazione funzionale (ANNOVAR, VEP, SnpEff)
- Visualizzazione (IGV, Circos)
- Automazione dei workflow (Snakemake, Nextflow)
Deliverables
- Dataset puliti e processati
- Figure di qualità pubblicabile
- Rapporto dettagliato di analisi
- Script riproducibili (R/Python)
