Eseguirò analisi di espressione differenziale rnaseq con deseq2 o edger

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Analizzerò i tuoi dati proteomici LC MSMS e consegnerò risultati pronti per la pubblicazione

Ricercatore universitario specializzato in proteomica LC-MS/MS, trascrittomica e integrazione multi-omics. Pubblico su riviste come Scientific Reports (Nature) e lavoro quotidianamente con MaxQuant, D...
Informazioni su questo servizio

Hai bisogno di aiuto con i tuoi dati RNA-seq? Sono un ricercatore universitario pubblicato su Scientific Reports (Nature), specializzato in analisi multi-omics per la scoperta di biomarcatori.


Lavoro quotidianamente con DESeq2, edgeR e limma, non solo per confronti tra due gruppi, ma anche per disegni complessi: campioni accoppiati, serie temporali, esperimenti multi-fattoriali e effetti batch.


Ciò che offro:

Filtraggio di qualità e normalizzazione

Analisi di espressione differenziale (DESeq2/edgeR)

Volcano plot, heatmap, MA plot, PCA di qualità pubblicabile

Enrichment di set di geni e analisi di pathway (GO, KEGG, GSEA)

Script R inclusi nelle tier Standard & Premium


Lavoro con: matrici di conteggio da featureCounts, HTSeq, STAR, Salmon o qualsiasi pipeline standard.


Nota: il tier Basic copre solo QC e analisi esplorativa, senza test di differenza.

Tecnologia:

RStudio

Altro

Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

Analisi statistica

Expertise:

Progettazione esperimenti

Statistiche

Linguaggio di programmazione:

Python

R