Eseguirò analisi di espressione differenziale rnaseq con deseq2 o edger
Analizzerò i tuoi dati proteomici LC MSMS e consegnerò risultati pronti per la pubblicazione
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno di aiuto con i tuoi dati RNA-seq? Sono un ricercatore universitario pubblicato su Scientific Reports (Nature), specializzato in analisi multi-omics per la scoperta di biomarcatori.
Lavoro quotidianamente con DESeq2, edgeR e limma, non solo per confronti tra due gruppi, ma anche per disegni complessi: campioni accoppiati, serie temporali, esperimenti multi-fattoriali e effetti batch.
Ciò che offro:
Filtraggio di qualità e normalizzazione
Analisi di espressione differenziale (DESeq2/edgeR)
Volcano plot, heatmap, MA plot, PCA di qualità pubblicabile
Enrichment di set di geni e analisi di pathway (GO, KEGG, GSEA)
Script R inclusi nelle tier Standard & Premium
Lavoro con: matrici di conteggio da featureCounts, HTSeq, STAR, Salmon o qualsiasi pipeline standard.
Nota: il tier Basic copre solo QC e analisi esplorativa, senza test di differenza.
Tecnologia:
RStudio
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Altro
Expertise:
Progettazione esperimenti
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Statistiche
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
FAQ
Traduzione automatica.
Q: Di cosa hai bisogno da me?
A: La tua matrice di conteggio e un foglio di metadati dei campioni che descrive gruppi e condizioni.
Q: Fornisci codice R?
A: Le versioni Standard e Premium includono script R commentati e specifici per il progetto. La versione Basic consegna solo i risultati.
Q: Puoi integrare con dati di proteomica?
A: Sì — l'integrazione multi-omics è la mia specialità. Scrivimi per un preventivo personalizzato.
Q: I miei dati sono riservati?
A: Sì. I tuoi dati non vengono mai condivisi, riutilizzati o pubblicati. Posso firmare un NDA su richiesta.
Q: Puoi gestire effetti batch o disegni accoppiati?
A: Sì — modello covariate batch o accoppiamento nel design matrix e mostro PCA prima/dopo per mostrare la correzione.

