Eseguirò analisi dei dati NGS

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Bioinformatico

Offro servizi di analisi dei dati NGS, specializzandomi nella conversione di dati di sequenziamento grezzi (FASTQ) in risultati di varianti di alta qualità (VCF). Il mio workflow include: Controllo q...
Informazioni su questo servizio

Offro servizi professionali di analisi dei dati NGS, specializzandomi nella conversione di dati di sequenziamento grezzi (FASTQ) in risultati di varianti di alta qualità (VCF).

Realizzerò un pipeline completo e affidabile utilizzando strumenti standard di bioinformatica.

Cosa farò:

  • Controllo qualità dei FASTQ (FastQC, fastp)
  • Allineamento delle sequenze usando BWA
  • Elaborazione BAM con SAMtools
  • Chiamata di varianti usando GATK
  • Output VCF pulito e riproducibile

Cosa riceverai:

  • File BAM processati
  • File VCF finale
  • Sintesi delle operazioni eseguite

️ Importante:

  • Adatto per dataset di ricerca e accademici
  • Dataset di grandi dimensioni potrebbero richiedere tempo o risorse aggiuntive

Se hai esigenze specifiche, sentiti libero di contattarmi prima di effettuare un ordine.

Tecnologia:

Quaderno jupyter

RStudio

Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

Analisi qualitativa

Expertise:

Predizione

Linguaggio di programmazione:

Python

R

SQL