Eseguirò pipeline di bioinformatica per rnaseq e metagenomica
Trasformare dati biologici complessi in risultati chiari e attuabili
Informazioni su questo servizio
Se hai bisogno di un workflow personalizzato di RNA-Seq, analisi della diversità microbica o di una pipeline multi-omics creata da zero, progetterò soluzioni di bioinformatica riproducibili e scalabili su misura per i tuoi dati. Con esperienza pratica in HPC e Linux, creo workflow puliti e ben documentati, così puoi concentrarti sulla scienza, non sul codice.
Ciò che posso fare per te: Dai raw reads ai risultati finali, gestisco l'intero pipeline: controllo qualità, trimming, allineamento, quantificazione, espressione differenziale e visualizzazione. Per la metagenomica, copro il profiling tassonomico, diversità alpha/beta e analisi delle comunità microbiche.
Strumenti & Software: Lavoro con strumenti di settore come FastQC, Trimmomatic, HISAT2, DESeq2, STAR, QIIME2, Kraken2, Bash/Linux, SLURM e R, assicurando che il tuo pipeline sia potente e riproducibile.
Perché lavorare con me: Ogni pipeline viene consegnata con documentazione chiara e un README, così il tuo team può mantenerla e riutilizzarla. Gli script sono ottimizzati per cluster HPC, scalabili su grandi dataset e completamente riproducibili. Che tu sia un ricercatore accademico, una startup biotech o un laboratorio clinico, consegno risultati affidabili e su cui puoi contare e costruire.
Tipo di servizio:
Analisi
Lingua:
Inglese
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Francese
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