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Prevedrò la struttura proteica usando alphafold e eseguirò analisi di docking
Scrittore di curriculum, CV e lettera di presentazione, specialista in scienza e accademia
Aiuto studenti, ricercatori e professionisti in due modi: creando curriculum, CV e lettera di presentazione chiari e ottimizzati per ATS, e offrendo predizioni di strutture proteiche e analisi di dock...
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno di una struttura 3D per una proteina che stai studiando, ma non esiste una struttura sperimentale? Uso AlphaFold (tramite ColabFold) per prevedere strutture proteiche 3D accurate direttamente dalla tua sequenza di aminoacidi, oltre a docking molecolare opzionale e visualizzazioni pulite.
Come studente di Microbiologia e Genetica Molecolare, comprendo la biologia dietro i dati, non solo il software, quindi posso aiutarti a interpretare i risultati, non solo a generare file.
Ciò che ottieni:
- Una struttura 3D prevista (file PDB) dalla tua sequenza
- Punteggi di fiducia (pLDDT) spiegati in modo semplice
- Analisi di docking opzionale con un ligando o una seconda proteina
- Immagini di visualizzazione pulite adatte per report o presentazioni
- Codice sorgente e un riassunto scritto sui livelli superiori
Importante: le strutture previste sono stime computazionali, più adatte per ricerca, compiti e generazione di ipotesi. Per pubblicazioni o certezza clinica, è comunque consigliata la validazione sperimentale, e sarò sempre trasparente sui livelli di fiducia.
Scrivimi con la tua sequenza o ID PDB e cosa vuoi scoprire. Felice di consigliarti prima di ordinare!
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
•
Colab
Framework:
Altro
API:
Altro
Strumenti:
Quaderno jupyter
•
Colab
•
Altro
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Quanto è accurata la previsione di AlphaFold?
Molto accurata per molte proteine, spesso di qualità quasi sperimentale. Riporto sempre il punteggio di fiducia (pLDDT) così sai quanto fidarti di ogni regione della struttura.
È un sostituto per la determinazione sperimentale della struttura?
No — è un ottimo punto di partenza per ricerca e generazione di ipotesi, ma per pubblicazioni o uso clinico di solito serve comunque la validazione sperimentale (X-ray/cryo-EM).
Qual è la differenza tra i pacchetti?
La Structure Prediction ti dà il modello 3D di base. Prediction + Docking aggiunge analisi di interazione con un ligando o proteina. Il Full Analysis Package include tutto più codice sorgente e un rapporto dettagliato scritto.
Quali formati di file ricevo?
Un file PDB per la struttura, immagini di visualizzazione PNG/JPG e (su Standard/Premium) un riassunto scritto in PDF o Word.
Puoi gestire proteine grandi o complessi proteici?
Sì, entro certi limiti — scrivimi con la lunghezza della tua sequenza prima di ordinare così posso confermare fattibilità e tempi.
Offri questo servizio anche per studenti con budget limitato?
Sì — il pacchetto di previsione della struttura è pensato appositamente per compiti e uso studentesco.
