Eseguirò docking molecolare e dinamiche molecolari

Stai conducendo ricerche in scoperta di farmaci, inibizione di enzimi o analisi di interazioni proteina-ligando?

Offro servizi professionali di docking molecolare combinati con simulazioni di Molecular Dynamics (MD) di base fino a 1 nanosecondo (1 ns) per valutare la stabilità dei complessi dockati. Il mio workflow segue protocolli standard di scoperta di farmaci computazionale, adatti a scopi accademici e di ricerca.

Servizi di docking molecolare:

• Preparazione di proteine e ligandi
• Identificazione del sito attivo e ottimizzazione della griglia
• Docking usando AutoDock Vina
• Affinità di binding
• Visualizzazione delle interazioni 3D
• Immagini ad alta risoluzione, di qualità per pubblicazioni

Simulazione di Molecular Dynamics di base (fino a 1 ns):

Per validare ulteriormente i risultati del docking, fornisco analisi preliminare di stabilità MD, che include:

• Preparazione del sistema e solvatazione
• Minimizzazione dell'energia
• Equilibration (NVT/NPT)
• Esecuzione di produzione fino a 1 ns
• RMSD
• RMSF
• Analisi dei legami idrogeno
• Grafici e diagrammi chiari pronti per report o pubblicazioni

Ideale per

• Progetti di ricerca BS / MS / PhD
• Sostegno a tesi o dissertazioni
• Preparazione di pubblicazioni su riviste
• Studi di scoperta di farmaci computazionale

Contattami prima di ordinare per discutere del tuo progetto.

Grazie per la visita.