Eseguirò analisi deg e pathway in bulk rnaseq

Benvenuto nel mio GiG,

Se cerchi analisi di bulk RNA-seq accurate, ripetibili e pronte per la pubblicazione

Offro analisi personalizzate di dati trascrittomici per ricercatori, laboratori e professionisti della biotecnologia. Posso lavorare con matrici di conteggio raw o file FASTQ, a seconda del pacchetto scelto.

I servizi possono includere:

• Controllo qualità FASTQ e report MultiQC
• Taglio delle read, allineamento o quantificazione dei trascritti
• Generazione di conteggi a livello genico
• Normalizzazione, PCA e correlazione tra campioni
• Analisi di espressione differenziale
• Volcano plot, MA plot e heatmap
• Enrichment di Gene Ontology e pathway
• Figure pronte per la pubblicazione e tabelle di risultati
• Script R e rapporto di interpretazione chiaro

Utilizzo strumenti consolidati come FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, DESeq2, edgeR e clusterProfiler su ambiente Linux.

Contattami prima di ordinare per file FASTQ raw, organismi non modello, progetti complessi o più di 12 campioni. I risultati dipendono dalla qualità dei dati e dal disegno sperimentale.